Попросить партнеров установить ссылку вида http://site.ru/?id=ид_партнера, после чего в индексном файле, если существует этот ид, записать в БД IP, User Agent, refferer...
Потом, если с одного IP слишком много запросов можно будет подумать, что партнер нечестный, также если refferer не совпадает с сайтом партнера, то тоже что-то не чисто...