Если брать за основу, то что сайт с которого переходят - ваш сайт, то я пользователя, который кликнул по банеру перекидывал бы на скрипт который записывал данный файт перехода, а по выполнению скрипт пересылал бы пользователя на сайт, на который должен был вести банер..