Форум PHP

Если у вас имеется SSH-аккаунт можно зайти при помощи SSH-клиента, например, PuTTY и выполнить любую команду как если бы вы находились на удалённой машине.

Тогда передавайте серверу имя команды и заключайте его в обратные кавычки (буква Ё в английской раскладке) или используйте для этого функцию exec() или system(), которые выполняют команды операционной системы.

а через SSH как можно сделать?

http://ru.php.net/exec

сделать надо на PHP
сервера наши

Нужно больше подробностей, вы это из PHP хотите сделать или SSH тоже для этой цели сгодится - это ваши сервера или вы хотите запустить скрипт на чужом сервере?

подскажите как мне запустить командный файл на отдаленной машине(linux) и получить результат его выполнения