"." - означает чт имеется ввиду имено этот каталог в котором выполняется скрипт, а ".." - имеется ввиду каталог находящийся на уровень выше, например имеется сайт такого вида site.ru/katalog/katalog2/qwe/... Если в каталоге katalog2 будет стоять "./qwe", это значит перейти с этого каталога в каталог qwe (аналогично "/qwe"), а запись "../katalog1", означает следующее, перейти с коталога katalog, в коталог katalog1